种薯带菌，土壤一般不带菌。病菌先通过切薯块扩大传染，引起更多种薯发病，再经维管束或髓部进入植株，引起地上部发病。田间病菌还可通过灌溉水、雨水或昆虫传播，经伤口侵入致病，后期病株上的病菌又从地上茎通过匍匐茎传到新长出的块茎上。贮藏期病菌通过病健薯接触经伤口或皮孔侵入使健薯染病。
马铃薯黑胫病的病菌先通过切薯块扩大传染，引起更多种薯发病，再经维管束或髓部进入植株，引起地上部发病。
细菌引起的。主要是病薯带菌，病菌通过切薯传播种薯，造成母薯腐烂，并从亩薯进入植株地上茎。田间病菌可通过雨水或昆虫传播，从伤口再浸染健株。雨水多、低洼地发病重，贮藏期和窖内通气不良，温度高，湿度大，容易造成烂窖。
