发病初期用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，或65%代森锰锌可湿性粉剂500倍液，或70%百菌清可湿性粉剂800倍液，或20%三唑酮乳油3000倍液，或50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液喷雾防治。发病中期用98％恶霉灵2000～3000倍灌根。
玉米茎腐病可以选用多菌灵＋农用硫酸链霉素喷雾防治。
可用70%甲基托布津等药剂进行防治。
1:选择抗病品种。2:作物轮作，合理密植，及时防治黏虫、玉米螟和地下害虫等等。
发现零星病株可用甲霜灵400倍液或多菌灵500倍液喷根茎或灌根，每隔7～10天喷1次，连治2～3次，有较好的治疗效果。
