疫病一般侵害瓜根颈部，还可侵害叶、蔓和果实。根颈部发病初期产生暗绿色水渍状病斑，病斑迅速发展环绕茎基呈软腐状、缢缩、全株萎蔫枯死，叶片呈青枯状，维管束不变色。有时在主根中下部发病，产生类似症状，病部软腐，地上部青枯。
西瓜的叶、茎、果实均发病。危害幼苗，造成幼苗猝倒死亡。危害幼株时，茎基变色，叶萎凋，全株初青枯，后枯死。靠叶柄的茎节常水渍状软化，严重时根断续褐腐。成株期染病，叶面初生暗绿色水渍状圆形至不规则形病斑，湿度大时或雨后似开水烫状，干燥时易破碎。茎基部染病，初现暗绿色纺锤形水渍状斑，后腐烂，病部以上枯死。果实染病，果面上现暗绿色不规则形、大小不一水渍状凹陷斑，湿度大时迅速扩展到大半个果实，表面产生稀疏白。
子叶染病初期出现暗绿色圆形斑，中央逐渐变成红褐色，近地面处溢缩或枯死。茎基部染病，生纺锤形水渍状暗绿色凹陷斑，包围茎部且腐烂，患部益善全部枯死。果实染病，会形成暗绿色圆形水渍状凹陷斑，迅速扩大至全果，致使果实腐烂，发出青储饲料的气味，病部表面有白色菌丝。
