在发病初期喷洒50%甲基托布津可湿性粉剂800倍液加75%百菌清可湿性粉剂800倍液，或50%多菌灵可湿性粉剂800倍液加75%百菌清可湿性粉剂800倍液混合喷洒。此外，还可选用36%甲基硫菌灵悬浮剂500倍液、80%炭疽福美可湿性粉剂800倍液、2%抗霉菌素（120）水剂200倍液、2%武夷菌素（BO-10）水剂150倍液，隔7-10天1次，连续防治2-3次。
西瓜炭疽病，应采取选用抗病品种，嫁接育苗，科学肥水管理，合理调节温度湿度，增加光照，喷施代森锰锌、咪鲜胺、苯醚甲环唑等药剂进行防治。
若种植田块的地势较低、湿度较大，为了保证产量，一定要注意栽培密度的选取，同时雨天要及时排水。中管棚和连栋大棚要科学施肥，在施足有机肥的前提下，于西瓜生育前、中期增施氮、磷、钾三要素复合肥。浇水施肥时要小水、少肥、勤浇，平时注意开棚通风降湿。
采用80％代森锰锌可湿性粉剂（大生）700至800倍液，或者30%苯醚甲环唑咪1500-2000倍进行灌根涂抹来做好病前预防，如果已经发病，则使用30%苯醚甲环唑咪500-800倍进行喷雾或涂抹。
在发病初期及时喷药，可取得较好的防治效果。可选用70%甲基硫菌灵600倍液，或20%施宝灵3000倍液，或15%粉锈灵1000倍液，或70%代森锰锌500倍液，或60%百菌通500倍液。每隔7～10天喷药1次，连喷3～4次。
进行种子浸种消毒。即在55°C温水浸种15分钟后冷却；或用如金种植专用（原液）500倍稀释液浸种24小时，清水洗净后催芽播种。
