西瓜茎尖的生长速度变缓慢，甚至出现停止生长的情况，嫩尖弯曲常出现裂口；花朵发育不正常，雌蕊柱头短小，授粉不良，出现大量落花的现象；嫩叶生长异常，叶子卷曲、变小、肥厚、皱缩、无法展平，类似感染了病毒的症状；果实发育也非常缓慢，果小，部分穗不结实，块根、浆果出现中心黑腐和坏死的情况。
果实发育非常缓慢，果小，部分穗不结实，块根、浆果出现中心黑腐和坏死的情况。
果实发育缓慢，果小；叶卷曲小而厚、皱缩：
西瓜缺硼时，从伸蔓期开始，藤蔓丛生，生长点受到抑制，发白，叶片小，叶面皱缩，凸凹不平，往往会误诊为病毒病。缺硼植株的新蔓上有横向裂纹，脆而易断，有时有褐色黏稠状物流出，而西瓜病毒病无此现象；西瓜缺硼病没有发病中心，而西瓜病毒病有发病中心，并向四周蔓延。
